日本語 English
| 開講年度/ Academic YearAcademic Year |
20262026 |
| 科目設置学部/ CollegeCollege |
理学研究科/Graduate School of ScienceGraduate School of Science |
| 科目コード等/ Course CodeCourse Code |
LD103/LD103LD103 |
| テーマ・サブタイトル等/ Theme・SubtitleTheme・Subtitle |
|
| 授業形態/ Class FormatClass Format |
対面（全回対面）/Face to face (all classes are face-to-face)Face to face (all classes are face-to-face) |
| 授業形態（補足事項）/ Class Format (Supplementary Items)Class Format (Supplementary Items) |
対面 |
| 授業形式/ Class StyleCampus |
講義/LectureLecture |
| 校地/ CampusCampus |
池袋/IkebukuroIkebukuro |
| 学期/ SemesterSemester |
秋学期/Fall semesterFall semester |
| 曜日時限・教室/ DayPeriod・RoomDayPeriod・Room |
月3/Mon.3 Mon.3 ログインして教室を表示する（Log in to view the classrooms.） |
| 単位/ CreditsCredits |
22 |
| 科目ナンバリング/ Course NumberCourse Number |
LFS5290 |
| 使用言語/ LanguageLanguage |
日本語/JapaneseJapanese |
| 履修登録方法/ Class Registration MethodClass Registration Method |
科目コード登録/Course Code RegistrationCourse Code Registration |
| 配当年次/ Assigned YearAssigned Year |
配当年次は開講学部のR Guideに掲載している科目表で確認してください。配当年次は開講学部のR Guideに掲載している科目表で確認してください。 |
| 先修規定/ Prerequisite RegulationsPrerequisite Regulations |
|
| 他学部履修可否/ Acceptance of Other CollegesAcceptance of Other Colleges |
履修登録システムの『他学部・他研究科履修不許可科目一覧』で確認してください。 |
| 履修中止可否/ Course CancellationCourse Cancellation |
－（履修中止制度なし/ No system for cancellation) |
| オンライン授業60単位制限対象科目/ Online Classes Subject to 60-Credit Upper LimitOnline Classes Subject to 60-Credit Upper Limit |
|
| 学位授与方針との関連/ Relationship with Degree PolicyRelationship with Degree Policy |
各授業科目は、学部・研究科の定める学位授与方針（DP）や教育課程編成の方針（CP）に基づき、カリキュラム上に配置されています。詳細はカリキュラム・マップで確認することができます。 https://www.rikkyo.ac.jp/about/disclosure/educational_policy/science.html |
| 備考/ NotesNotes |
RD103生物物理学概論と合同授業 |
This course aims to explain sophisticated concepts in the biophysics of proteins, nucleic acids, and their interactions and to provide a detailed, consistent picture of gene regulation in bacteria.
This course aims to examine regulation of the lac operon at the atomic and molecular levels: DNA-protein interaction and modulation thereof, the j-factor and DNA looping, DNA bending, molecular diffusion in two and three dimensions, structural flexibility and transition of protein, bistability and stochasticity of transcription, and gene circuity.
| 1 | LacIのDNA結合（１） |
| 2 | LacIのDNA結合（２） |
| 3 | DNAルーピングとJ因子（１） |
| 4 | DNAルーピングとJ因子（２） |
| 5 | DNAの剛さと生物学（１） |
| 6 | DNAの剛さと生物学（２） |
| 7 | １次元と３次元での探索（１） |
| 8 | １次元と３次元での探索（２） |
| 9 | １次元と３次元での探索（３） |
| 10 | １次元と３次元での探索（４） |
| 11 | 遺伝子の回路と確率過程（１） |
| 12 | 遺伝子の回路と確率過程（２） |
| 13 | 遺伝子の回路と確率過程（３） |
| 14 | 遺伝子の回路と確率過程（４） |
板書 /Writing on the Board
スライド（パワーポイント等）の使用 /Slides (PowerPoint, etc.)
上記以外の視聴覚教材の使用 /Audiovisual Materials Other than Those Listed Above
個人発表 /Individual Presentations
グループ発表 /Group Presentations
ディスカッション・ディベート /Discussion/Debate
実技・実習・実験 /Practicum/Experiments/Practical Training
学内の教室外施設の利用 /Use of On-Campus Facilities Outside the Classroom
校外実習・フィールドワーク /Field Work
上記いずれも用いない予定 /None of the above
予習として、テーマに関連した学部レベルの生化学と分子生物学を復習しておくこと（各回２時間）
復習として、講義資料とQ&Aを精査すること（各回２時間）
| 種類 (Kind) | 割合 (%) | 基準 (Criteria) |
|---|---|---|
| 平常点 (In-class Points) | 100 |
リアクションペーパー(80%) 授業中に出す宿題(20%) |
| 備考 (Notes) | ||
| その他 (Others) | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| 講義資料をCanvasLMSで配付する。 |
| No | 著者名 (Author/Editor) | 書籍名 (Title) | 出版社 (Publisher) | 出版年 (Date) | ISBN/ISSN |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Rob Phillips ら | 『細胞の物理生物学』 | 共立出版 | 2011 | 9784320057166 |
リアクションペーパーへのフィードバックは次回授業で行うとともにCanvasLSMで配布する。宿題へのフィードバックは個人的に応じる。
「生きている」ことにはオカルトはない。つまり，物理法則に反する現象は起こっておらず，生命現象は物理化学の範囲内で成立している。
タンパク質や核酸の物理化学的性質や確率的現象によって，生物学的な機能が実現していること，さらには，物理化学的に可能な極限まで進化している場合もあることを理解する。
This course aims to explain sophisticated concepts in the biophysics of proteins, nucleic acids, and their interactions and to provide a detailed, consistent picture of gene regulation in bacteria.
タンパク質のDNA結合による遺伝子の発現制御は，本当に，特異的に，効率よく，速く，達成されているのだろうか？
lacオペロンを題材に，この問題に関する現在までの研究について述べる。その過程で，タンパク質や核酸分子の機能を理解するうえで重要な，構造生物学の基本，物理化学的や確率論的な概念や，研究の方法を説明する。
This course aims to examine regulation of the lac operon at the atomic and molecular levels: DNA-protein interaction and modulation thereof, the j-factor and DNA looping, DNA bending, molecular diffusion in two and three dimensions, structural flexibility and transition of protein, bistability and stochasticity of transcription, and gene circuity.
| 1 | LacIのDNA結合（１） |
| 2 | LacIのDNA結合（２） |
| 3 | DNAルーピングとJ因子（１） |
| 4 | DNAルーピングとJ因子（２） |
| 5 | DNAの剛さと生物学（１） |
| 6 | DNAの剛さと生物学（２） |
| 7 | １次元と３次元での探索（１） |
| 8 | １次元と３次元での探索（２） |
| 9 | １次元と３次元での探索（３） |
| 10 | １次元と３次元での探索（４） |
| 11 | 遺伝子の回路と確率過程（１） |
| 12 | 遺伝子の回路と確率過程（２） |
| 13 | 遺伝子の回路と確率過程（３） |
| 14 | 遺伝子の回路と確率過程（４） |
板書 /Writing on the Board
スライド（パワーポイント等）の使用 /Slides (PowerPoint, etc.)
上記以外の視聴覚教材の使用 /Audiovisual Materials Other than Those Listed Above
個人発表 /Individual Presentations
グループ発表 /Group Presentations
ディスカッション・ディベート /Discussion/Debate
実技・実習・実験 /Practicum/Experiments/Practical Training
学内の教室外施設の利用 /Use of On-Campus Facilities Outside the Classroom
校外実習・フィールドワーク /Field Work
上記いずれも用いない予定 /None of the above
予習として、テーマに関連した学部レベルの生化学と分子生物学を復習しておくこと（各回２時間）
復習として、講義資料とQ&Aを精査すること（各回２時間）
| 種類 (Kind) | 割合 (%) | 基準 (Criteria) |
|---|---|---|
| 平常点 (In-class Points) | 100 |
リアクションペーパー(80%) 授業中に出す宿題(20%) |
| 備考 (Notes) | ||
| その他 (Others) | |||||
|---|---|---|---|---|---|
| 講義資料をCanvasLMSで配付する。 |
| No | 著者名 (Author/Editor) | 書籍名 (Title) | 出版社 (Publisher) | 出版年 (Date) | ISBN/ISSN |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | Rob Phillips ら | 『細胞の物理生物学』 | 共立出版 | 2011 | 9784320057166 |
リアクションペーパーへのフィードバックは次回授業で行うとともにCanvasLSMで配布する。宿題へのフィードバックは個人的に応じる。